किसी रासायनिक तत्व के परमाणु के संबंध में, चुंबकीय क्वांटम संख्या (magnetic quantum number) इंगित करती है:

चुंबकीय क्वांटम संख्या (ml) किसी परमाणु कक्षक (atomic orbital) के त्रिविमीय समष्टि (three-dimensional space) में अभिविन्यास (orientation) का वर्णन करती है। किसी दिए गए उपकोश (subshell) के लिए (जो दिगंशी क्वांटम संख्या, l द्वारा निर्धारित होता है), चुंबकीय क्वांटम संख्या कक्षकों की संख्या और एक-दूसरे के सापेक्ष उनकी स्थानिक व्यवस्था (spatial arrangement) को निर्दिष्ट करती है। उदाहरण के लिए, l=1 (p उपकोश) के लिए, ml का मान -1, 0, +1 हो सकता है, जो क्रमशः x, y, और z अक्षों के अनुदिश अभिविन्यस्त px, py, और pz कक्षकों के अनुरूप है। A) अभिविन्यास (orientation): यह सही है। चुंबकीय क्वांटम संख्या यह निर्धारित करती है कि कोई कक्षक त्रिविमीय समष्टि में कैसे अभिविन्यस्त होता है। B) आकृति (shape): कक्षक की आकृति दिगंशी (कोणीय संवेग) क्वांटम संख्या (l) द्वारा निर्धारित होती है। उदाहरण के लिए, l=0 (s कक्षक) गोलाकार होता है, l=1 (p कक्षक) डम्बल के आकार का होता है। C) आकार (size): कक्षक का आकार और ऊर्जा मुख्य रूप से मुख्य क्वांटम संख्या (n) द्वारा निर्धारित होती है। उच्च n का अर्थ है एक बड़ा कक्षक। D) चक्रण (spin): इलेक्ट्रॉन के चक्रण का वर्णन चक्रण क्वांटम संख्या (ms) द्वारा किया जाता है, जिसका मान +1/2 या -1/2 हो सकता है, जो इलेक्ट्रॉन के आंतरिक कोणीय संवेग (intrinsic angular momentum) को दर्शाता है।